Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008–2009
Dulgheroff, A.C.B. Pereira, W.A.B. Sarmento, R.R. Silva, G.A.V. Naveca, F.G. Domingues, A.L.S.
Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008–2009
Publicação online; 11 ref.; 3 illus.; Summary (Pt)
RESUMO - O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes
podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.
Palavras-chave: rotavírus bovino, genotipagem, linhagem genética
BEZERRO LEITEIRO
LINHAGEM
ROTAVÍRUS
EPIDEMIOLOGIA
GENÓTIPO
Analysis of bovine rotavirus strains circulating in diarrheic dairy calves in Uberaba, Minas Gerais, Brazil, during 2008–2009
Publicação online; 11 ref.; 3 illus.; Summary (Pt)
RESUMO - O objetivo deste estudo foi detectar rotavírus em fezes de bezerros com diarreia em Uberaba, MG, e caracterizar os genes VP7 e VP4 por meio da genotipagem e da análise filogenética. Setenta e quatro amostras foram coletadas entre novembro de 2008 e setembro de 2009. A detecção do vírus foi feita por teste de aglutinação e as amostras positivas foram submetidas à transcrição reversa, seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR), tipagem por PCR e sequenciamento. A taxa de detecção de rotavírus foi de 6,8% e todas as amostras apresentaram o genótipo G6P[5]. A análise filogenética mostrou que as amostras do genótipo G6 pertencem à linhagem IV e que, para ambos os genes (VP7 e VP4), as amostras deste estudo compõem um sub-cluster à parte daquele das cepas referências e das amostras campo mais similares. O alinhamento das sequências de aminoácidos deduzidas mostrou substituições em regiões antigênicas quando comparadas com as sequências das cepas bovinas UK e NCDV, presentes nas vacinas disponíveis no Brasil. Uma nova sublinhagem genética de G6P[5] foi evidenciada neste estudo. Substituições de aminoácidos nas regiões antigênicas dos rotavírus e a circulação de novas variantes
podem representar desafios para as vacinas utilizadas atualmente. O presente estudo contribui para a compreensão da epidemiologia dos rotavírus bovinos no Brasil.
Palavras-chave: rotavírus bovino, genotipagem, linhagem genética
BEZERRO LEITEIRO
LINHAGEM
ROTAVÍRUS
EPIDEMIOLOGIA
GENÓTIPO
BINAGRI