Molecular characterization of the 5S rDNA non-transcribed spacer and reconstruction of phylogenetic relationships in Capsicum (Registro n. 337980)
[ somente texto ]
| 000 -LÍDER | |
|---|---|
| fixed length control field | 04312nab a2200301 i 4500 |
| 003 - CÓDIGO MARC DA AGÊNCIA CATALOGADORA | |
| Campo de controle | BR-BrBNA |
| 005 - DATA E HORA DA ÚLTIMA ATUALIZAÇÃO | |
| Campo de controle | 20250904052126.0 |
| 008 - CAMPO DE TAMANHO FIXO | |
| fixed length control field | 250904b2021 bl.ar|pooa||| 00| 0 eng | |
| 040 ## - FONTE DA CATALOGAÇÃO | |
| Agência catalogadora | BR-BrBNA |
| Idioma da catalogação | eng |
| 072 ## - CATEGORIA AGRIS | |
| Código AGRIS | F30 |
| 072 ## - CATEGORIA AGRIS | |
| Código AGRIS | F70 |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Grabiele, Mauro |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Aguilera, Patricia Mabel |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Ducasse, Daniel Adrián |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Debat, Humberto Julio |
| 245 ## - TÍTULO PRINCIPAL | |
| Título principal | Molecular characterization of the 5S rDNA non-transcribed spacer and reconstruction of phylogenetic relationships in Capsicum |
| 500 ## - NOTA GERAL | |
| Nota geral | Publicação on-line; Bibliography p. 18-21 (66 ref.); 2 tables; 10 illus.; Summaries (En, Es) |
| 942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA) | |
| Koha item type | Analítica |
| 520 ## - NOTA DE RESUMO | |
| Nota de conteúdo | <br/><br/>Abstract<br/><br/>Capsicum includes ca. 41 species of chili peppers. In this original report we PCR amplified, cloned, sequenced<br/>and characterized the 5S rDNA non-transcribed spacer -NTS- in 23 taxa of nine clades of Capsicum, divergent<br/>at geographical origin and fruit and chromosome traits, and compared the NTS features throughout Solanaceae.<br/>According to GC content, inner variability and regulatory elements, the NTS organizes into three distinct<br/>structural regions; genetic variability at the NTS in Capsicum and related genus clusters into defined taxa<br/>hierarchies. Based on the reconstruction of a maximum-likelihood phylogenetic tree and phylogenetic networks,<br/>NTS sequences of Capsicum and related taxa grouped into well recognized categories -genus, section, clade,<br/>species, variety-. An evolutionary scenario arose from combined genetic and phylogenetic NTS data, in<br/>which monophyly and lineage diversification over time of Capsicum are addressed. Our analysis is original<br/>to include all domesticated species of Capsicum prevailing in germplasm collections and breeding programs,<br/>together with a large group of wild taxa that demanded further genetic characterization. The NTS set up as<br/>a double purpose marker in Capsicum, to directly evaluate genetic variability and reconstruct phylogenetic<br/>relationships to a broad extent, and constitutes a valuable tool for germplasm characterization and evolutionary<br/>studies within Solanaceae.<br/><br/>Key words: chili peppers, genetic variability, molecular double purpose marker, phylogeny, ribosomal NTS.<br/><br/><br/><br/><br/><br/>Resumen<br/><br/>Capsicum incluye ca. 41 especies de ajíes. En este trabajo original, el espaciador no-transcrito (NTS) del ADNr<br/>5S fue PCR-amplificado, clonado, secuenciado y caracterizado en 23 taxones de nueve clados de Capsicum, <br/>divergentes en origen, fruto y cromosomas, y comparado a lo largo de Solanaceae. El NTS se organiza en tres<br/>regiones estructurales distintas de acuerdo a contenido GC, variabilidad y elementos reguladores; la variabilidad<br/>genética del NTS en Capsicum y géneros relacionados se agrupó en categorías taxonómicas definidas. Las<br/>secuencias NTS de Capsicum y taxa relacionados también se agruparon en categorías reconocidas -género,<br/>sección, clado, especie, variedad- durante la reconstrucción de un árbol filogenético de máxima-verosimilitud y<br/>diversas redes filogenéticas. De la combinación de datos genéticos y filogenéticos del NTS surge un escenario<br/>evolutivo que considera monofilia y diversificación de Capsicum a lo largo del tiempo. Nuestro análisis es<br/>original al incluir todas las especies domesticadas de Capsicum, mayoritarias en colecciones y programas,<br/>además de un amplio número de ajíes silvestres que demandaban mayor caracterización genética. El NTS<br/>constituye un marcador de doble propósito en Capsicum, al evaluar directamente variabilidad genética y<br/>reconstruir relaciones filogenéticas extensas, además de ser útil a la caracterización de germoplasma y estudios<br/>evolutivos en Solanaceae.<br/><br/>Palabras clave: ajíes, variabilidad genética, marcador molecular de doble propósito, filogenia, NTS ribosómico<br/> |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | PIMENTA |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | CAPSICUM SP |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | VARIAÇÃO GENÉTICA |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | MARCADOR MOLECULAR |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | FILOGENIA |
| 773 0# - ENTRADA ANALÍTICA | |
| Host Biblionumber | 709 |
| Registro do item | 357347 |
| Imprenta | Rio de Janeiro-RJ Jardim Botanico do Rio de Janeiro 1935 |
| Outro identificador | 2025-5311 |
| Título | Rodriguésia (Brazil) |
| ISSN | 0370-6583; 2175-7860 on-line |
| Colação | v. 72 p. 1-21; (2021) |
| Número de controle de registro | BR2025002188 |
| 856 ## - ACESSO E ENDEREÇO ELETRÔNICO | |
| Identificador uniforme de recurso - URI | https://www.scielo.br/j/rod/a/mKbrh6B3GsMRvJj3cf9fVFL/?format=pdf&lang=en |
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