Publicação on-line; 5 tables; Sumaries (En, Pt); Bibliography p. 8-11 (56 ref.)

Abstract – The objective of this work was to identify the quantitative trait loci
(QTLs) associated with grain yield in a rice segregant population (GYP). A
population of 245 inbred recombinant rice lines from the 'Epagri 108' (Oryza
sativa subsp. indica) x 'IRAT 122' (O. sativa subsp. japonica) cross was
evaluated at different locations and years and genotyped by single nucletide
polymorphism (SNP) markers. A map of 1,592.8 cM was obtained from
9,831 SNPs, identifying 25 QTLs. The following nine SNPs showed stability
between the different environments: M1.37719614 and M6.9563117 for GYP;
M4.29340056, M5.25588710, M7.29115624, and M12.4534450 for 100-grain
weight (HGW); and M1.38398157, M4.28368337, and M7.25991230 for plant
height (PH). Six SNPs were not present in the linkage blocks: M6.9563117
and M4.1077080 for GYP; M5.25588710 and M6.8886398 for HGW; and
M2.34471005 and M8.5955948 for PH. The M6.9563117 and M5.25588710
SNPs were considered environmentally stable and were not present in the
linkage blocks, showing their high potential for use in marker-assisted
selection for grain yield in Brazilian rice breeding programs.


Index terms: Oryza sativa, DArTseq, genotyping by sequencing, heritability,
molecular markers.

Resumo – O objetivo deste trabalho foi identificar locos de caracteres
quantitativos (QTLs) associados à produtividade em uma população
segregante de arroz (GYP). Uma população de 245 linhagens puras
recombinantes de arroz, do cruzamento 'Epagri 108' (Oryza sativa subsp.
indica) x 'IRAT 122' (O. sativa subsp. japonica), foi avaliada em diferentes
locais e anos e genotipada por marcadores de polimorfismo de nucleotídeo
único (SNPs). Obteve-se um mapa de 1.592,8 cM a partir de 9.831 SNPs,
tendo-se identificado 25 QTLs. Os seguintes nove SNPs apresentaram
estabilidade entre os diferentes ambientes: M1.37719614 e M6.9563117
para GYP; M4.29340056, M5.25588710, M7.29115624 e M12.4534450 para
peso de 100 grãos (HGW); e M1.38398157, M4.28368337 e M7.25991230
para altura de plantas. Seis SNPs não estavam presentes nos blocos de
ligação: M6.9563117 e M4.1077080 para GYP; M5.25588710 e M6.8886398
para HGW; e M2.34471005 e M8.5955948 para altura de plantas. Os SNPs
M6.9563117 e M5.25588710 foram considerados ambientalmente estáveis e
não estiveram presentes em blocos de ligação, o que indica seu alto potencial
para uso na seleção assistida por marcadores de produtividade de grãos, em
programas brasileiros de melhoramento de arroz.


Termos para indexação: Oryza sativa, DArTseq, genotipagem por
sequenciamento, herdabilidade, marcadores moleculares.