Adjustment of mixed nonlinear models on Blackberry fruit growth
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Em: Revista Brasileira de Fruticultura (Brazil) v. 45 p. 1-16; (2023)Sumário:
Abstract - Blackberry fruits belong to the genus Rubus, are fruits more cultivated in temperate climate in the summer, with low luminosity and low temperature in the winter. These fruits have as characteristic the quickperishingafter harvest and regression models, more specifically, nonlinear models, single or double sigmoid growth curve, are more recommended to model the growth of living beings. Several authors have used these models, considering only the average data of individuals under study; however, they do not consider the variability between them. One way to better capture the variability between individuals is by using mixed-effects nonlinear models that, by definition, combine the fixed and random part in the same model. Data used in this work were diameter and length of ‘Choctaw’ blackberry fruits, . The random effects of models were tested on parameters, with some steps, in order to reach the most appropriate model. For fixed-effects models, the least squares method was used, and for mixed models, the restricted likelihood was used. To reach the model that best fits data, the fit quality criteria (R2, AICc and TRV) were used. For fruit diameter, the simple sigmoid nonlinear model was the logistic with random effect in β1 and β2, and for fruit length, the model was the Logistic + Logistic, with random effect in β1 and β4.
Index terms - ‘Choctaw’ cultivar; Restricted likelihood; Variability; EstimationSumário:
Resumo - Os frutos de amora-preta pertencem ao gênero Rubus, são frutos mais cultivados em clima moderado, no verão, com pouca luminosidade e baixa temperatura no inverno. Esses frutos têm por característica perecerem de forma rápida após a colheita, e os modelos de regressão, mais especificamente, os não lineares, de crescimento sigmoide simples ou duplo, são mais recomendados para se modelar o crescimento de seres vivos. Diversos autores utilizam esses modelos, levando em consideração apenas os dados médios dos indivíduos em estudo; contudo, não levam em consideração a variabilidade existente entre eles. Uma forma de captar melhor a variabilidade existente entre os indivíduos é utilizando os modelos não lineares de efeitos mistos que, por definição, combinam a parte fixa e aleatória no mesmo modelo. Os dados utilizados, neste trabalho, foram o diâmetro e o comprimento dos frutos de amora-preta, cultivar Choctaw. Os efeitos aleatórios dos modelos foram testados nos parâmetros, com algumas etapas, a fim de chegar ao modelo mais adequado. Para os modelos de efeitos fixos, o método de mínimos quadrados foram utilizados, e para os modelos mistos a verossimilhança restrita. Para se chegar ao modelo que melhor se ajuste aos dados, os critérios qualidade de ajuste (R2aj, AICc and TRV) foram utilizados. Para o diâmetro dos frutos, o modelo não linear sigmoide simples foi o logístico, com efeito aleatório no β1 and β2; já, para o comprimento, foi o Logístico + Logístico, tendo o efeito aleatório no β1 and β4
Termos de indexação - Cultivar Choctaw; Verossimilhança restrita; Variabilidade; Estimação
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Periódicos
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Biblioteca Nacional de Agricultura - Binagri | Periódicos agrícolas | 2023 v. 45 | Texto integral (PDF) | Consulta local | 2025-2069 |
Publicação online; 38 ref.; 12 illus.; 5 tables; Summaries (En, Pt)
Abstract - Blackberry fruits belong to the genus Rubus, are fruits more cultivated in temperate climate in the summer, with low luminosity and low temperature in the winter. These fruits have as characteristic the quickperishingafter harvest and regression models, more specifically, nonlinear models, single or double sigmoid growth curve, are more recommended to model the growth of living beings. Several authors have used these models, considering only the average data of individuals under study; however, they do not consider the variability between them. One way to better capture the variability between individuals is by using mixed-effects nonlinear models that, by definition, combine the fixed and random part in the same model. Data used in this work were diameter and length of ‘Choctaw’ blackberry fruits, . The random effects of models were tested on parameters, with some steps, in order to reach the most appropriate model. For fixed-effects models, the least squares method was used, and for mixed models, the restricted likelihood was used. To reach the model that best fits data, the fit quality criteria (R2, AICc and TRV) were used. For fruit diameter, the simple sigmoid nonlinear model was the logistic with random effect in β1 and β2, and for fruit length, the model was the Logistic + Logistic, with random effect in β1 and β4.
Index terms - ‘Choctaw’ cultivar; Restricted likelihood; Variability; Estimation
Resumo - Os frutos de amora-preta pertencem ao gênero Rubus, são frutos mais cultivados em clima moderado, no verão, com pouca luminosidade e baixa temperatura no inverno. Esses frutos têm por característica perecerem de forma rápida após a colheita, e os modelos de regressão, mais especificamente, os não lineares, de crescimento sigmoide simples ou duplo, são mais recomendados para se modelar o crescimento de seres vivos. Diversos autores utilizam esses modelos, levando em consideração apenas os dados médios dos indivíduos em estudo; contudo, não levam em consideração a variabilidade existente entre eles. Uma forma de captar melhor a variabilidade existente entre os indivíduos é utilizando os modelos não lineares de efeitos mistos que, por definição, combinam a parte fixa e aleatória no mesmo modelo. Os dados utilizados, neste trabalho, foram o diâmetro e o comprimento dos frutos de amora-preta, cultivar Choctaw. Os efeitos aleatórios dos modelos foram testados nos parâmetros, com algumas etapas, a fim de chegar ao modelo mais adequado. Para os modelos de efeitos fixos, o método de mínimos quadrados foram utilizados, e para os modelos mistos a verossimilhança restrita. Para se chegar ao modelo que melhor se ajuste aos dados, os critérios qualidade de ajuste (R2aj, AICc and TRV) foram utilizados. Para o diâmetro dos frutos, o modelo não linear sigmoide simples foi o logístico, com efeito aleatório no β1 and β2; já, para o comprimento, foi o Logístico + Logístico, tendo o efeito aleatório no β1 and β4
Termos de indexação - Cultivar Choctaw; Verossimilhança restrita; Variabilidade; Estimação

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