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Molecular markers indicate the phylogenetic identity of southern Brazilian sea asparagus: first record of Salicornia neei in Brazil

Por: Tipo de material: ArtigoArtigoAssunto(s): Recursos online: Em: Rodriguésia (Brazil) v. 70 p. 1-10; (2019)Sumário: Abstract Molecular phylogenetic analyses based on ETS, ITS and atpB-rbcL spacer sequences assessed the phylogenetic status of the southern Brazil sea asparagus species of the genus Salicornia (Salicornioideae, Amaranthaceae). Accessions of Patos Lagoon estuary (32° S) were obtained from wild plants and two pure line lineages, selected from contrasting prostrate (BTH1) and decumbent (BTH2) ecomorphotypes found locally. Patos Lagoon wild plants, BTH1 and BTH2 f4 progenies showed 100% identical sequences for the atpB-rbcL and ITS spacers, only two mutations for ETS. Comparison of the sequences of these three markers with GenBank records confirmed the identity of Brazilian accessions as Salicornia neei. Maximum-likelihood phylogenetic analysis of ETS sequences indicated that the southern Brazilian accessions of Salicornia certainly are not close to any of the Salicornia ambigua accessions in GenBank, which are restricted to the northern hemisphere, nor are they related to any Salicornia fruticosa/Salicornia perennis clade accessions, which are also restricted to Eurasia. All above cited species have been wrongly applied to the southern Brazil sea asparagus. Key words: DNA sequences, Salicornioideae, Sarcocornia, halophyte, salt marshes. Resumo Análises filogenéticas moleculares baseadas em sequências das regiões espaçadoras ETS, ITS and atpB- rbcL avaliaram o status filogenético da espécie de aspargo marinho do gênero Salicornia (Salicornioideae, Amaranthaceae) presente no sul do Brasil. Os acessos do estuário da Lagoa dos Patos (32° S) foram obtidos de uma população selvagem e de duas linhagens puras de aspargo marinho, selecionadas de ecomorfotipos contrastantes com forma de crescimento prostrada (BTH1) e decumbente (BTH2) encontrados localmente. Plantas selvagens do estuário da Lagoa dos Patos e as progênies f4 de BTH1 e BTH2 mostraram sequencias 100% idênticas para a região espaçadora atpB-rbcL e ITS, apenas duas mutações em ETS. A comparação das sequências desses três marcadores com registros do GenBank confirmou a identidade dos acessos como Salicornia neei. Análise filogenética pelo método de máxima verossimilhança das sequências ETS indicou que os acessos de Salicornia do sul do Brasil certamente não são semelhantes a nenhum acesso de Salicornia ambigua no GenBank, os quais possuem distribuição restrita ao hemisfério norte, e nem são relacionados com qualquer acesso do clado Salicornia fruticosa/Salicornia perennis, este último restrito a Eurásia. Todas as espécies citadas acima têm sido erroneamente consideradas como sinonímias para o aspargo marinho do sul do Brasil. Palavras-chave: sequências de DNA, Salicornioideae, Sarcocornia, halófitas, marismas.
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Periódicos Periódicos Biblioteca Nacional de Agricultura - Binagri Periódicos agrícolas 2019 70 Texto integral (PDF) Consulta local 2025-3977

Publicação on-line; 28 ref.; 2 tables; 1 illus.; Summaries (En, Pt)



Abstract

Molecular phylogenetic analyses based on ETS, ITS and atpB-rbcL spacer sequences assessed the phylogenetic
status of the southern Brazil sea asparagus species of the genus Salicornia (Salicornioideae, Amaranthaceae).
Accessions of Patos Lagoon estuary (32° S) were obtained from wild plants and two pure line lineages, selected
from contrasting prostrate (BTH1) and decumbent (BTH2) ecomorphotypes found locally. Patos Lagoon wild
plants, BTH1 and BTH2 f4 progenies showed 100% identical sequences for the atpB-rbcL and ITS spacers,
only two mutations for ETS. Comparison of the sequences of these three markers with GenBank records
confirmed the identity of Brazilian accessions as Salicornia neei. Maximum-likelihood phylogenetic analysis
of ETS sequences indicated that the southern Brazilian accessions of Salicornia certainly are not close to
any of the Salicornia ambigua accessions in GenBank, which are restricted to the northern hemisphere, nor
are they related to any Salicornia fruticosa/Salicornia perennis clade accessions, which are also restricted to
Eurasia. All above cited species have been wrongly applied to the southern Brazil sea asparagus.

Key words: DNA sequences, Salicornioideae, Sarcocornia, halophyte, salt marshes.





Resumo

Análises filogenéticas moleculares baseadas em sequências das regiões espaçadoras ETS, ITS and atpB- rbcL
avaliaram o status filogenético da espécie de aspargo marinho do gênero Salicornia (Salicornioideae,
Amaranthaceae) presente no sul do Brasil. Os acessos do estuário da Lagoa dos Patos (32° S) foram obtidos
de uma população selvagem e de duas linhagens puras de aspargo marinho, selecionadas de ecomorfotipos
contrastantes com forma de crescimento prostrada (BTH1) e decumbente (BTH2) encontrados localmente.
Plantas selvagens do estuário da Lagoa dos Patos e as progênies f4 de BTH1 e BTH2 mostraram sequencias
100% idênticas para a região espaçadora atpB-rbcL e ITS, apenas duas mutações em ETS. A comparação
das sequências desses três marcadores com registros do GenBank confirmou a identidade dos acessos como
Salicornia neei. Análise filogenética pelo método de máxima verossimilhança das sequências ETS indicou
que os acessos de Salicornia do sul do Brasil certamente não são semelhantes a nenhum acesso de Salicornia
ambigua no GenBank, os quais possuem distribuição restrita ao hemisfério norte, e nem são relacionados
com qualquer acesso do clado Salicornia fruticosa/Salicornia perennis, este último restrito a Eurásia. Todas
as espécies citadas acima têm sido erroneamente consideradas como sinonímias para o aspargo marinho do
sul do Brasil.

Palavras-chave: sequências de DNA, Salicornioideae, Sarcocornia, halófitas, marismas.

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