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Structure and genetic diversity of Theobroma speciosum (Malvaceae) and implications for Brazilian Amazon conservation

Por: Tipo de material: ArtigoArtigoAssunto(s): Recursos online: Em: Rodriguésia (Brazil) v. 72 p. 1-11; (2021)Sumário: Abstract The genetic diversity of Theobroma speciosum is important because its use in breeding programs, once the species is closely related to species of great economic value such as Theobroma cacao (cocoa) and Theobroma grandiflorum (cupuaçu). Thus, the objective of this work is to characterize the intra and interpopulational genetic diversity of Theobroma speciosum in natural populations in the Brazilian Amazon. Ninety individuals of T. speciosum from four populations localized in different states of legal Amazon were selected and genotyped. The data were obtained by fluorescence microsatellite analysis and the number of alleles, number of private alleles, fixation index, observed and expected heterozygosity were analyzed. Bayesian analysis, AMOVA and PCOa were used to reveal the molecular genetic structure of the populations, using the programs Structure and GenAIEx 6.5, respectively. All populations studied present great levels of gene diversity, although, there was a greater similarity among the AUR, API and MAC populations, while RBC population presented higher heterozygosity and less inbreeding than the others, becoming a possible refuge area in the Amazon, and the most important population for T. speciosum conservation. Key words: Amazon, cacauhy, genetic variability. Resumo O estudo da diversidade genética de Theobroma speciosum é importante, pois pode ser utilizado em programas de melhoramento, uma vez que a espécie está intimamente relacionada a espécies de grande valor econômico, como Theobroma cacao (cacau) e Theobroma grandiflorum (cupuaçu). Assim, o objetivo deste trabalho é caracterizar a diversidade genética intra e interpopulacional de Theobroma speciosum em populações naturais na Amazônia brasileira. Foram selecionados e genotipados 90 indivíduos de T. speciosum provenientes de quatro populações situadas em diferentes estados da Amazônia Legal. Os dados foram obtidos por meio da análise de microssatélite e a diversidade genética foi caracterizada através do número de alelos, número de alelos privados, índice de fixação e heterozigosidade observada e esperada. A análise bayesiana, a AMOVA e PCOa foram utilizadas para revelar a estrutura genética molecular das populações, através dos programas Structure e GenAIEx 6.5, respectivamente. Todas as populações estudadas apresentaram níveis de diversidade gênica, contudo, as populações AUR, API e MAC apresentaram grande similaridade, enquanto a população de Rio Branco apresentou maior heterozigosidade e menor endogamia do que as outras, se tornando um ponto de refúgio na Amazônia, e a mais importante população para a conservação de T. speciosum. Palavras-chave: Amazônia, cacauí, variabilidade genética.
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Periódicos Periódicos Biblioteca Nacional de Agricultura - Binagri Periódicos agrícolas 2021 72 Texto integral (PDF) Consulta local 2025-5311

Publicação on-line; 42 ref.; 4 tables; 4 illus.; Summaries (En, Pt)



Abstract

The genetic diversity of Theobroma speciosum is important because its use in breeding programs, once the
species is closely related to species of great economic value such as Theobroma cacao (cocoa) and Theobroma
grandiflorum (cupuaçu). Thus, the objective of this work is to characterize the intra and interpopulational
genetic diversity of Theobroma speciosum in natural populations in the Brazilian Amazon. Ninety individuals of
T. speciosum from four populations localized in different states of legal Amazon were selected and genotyped.
The data were obtained by fluorescence microsatellite analysis and the number of alleles, number of private
alleles, fixation index, observed and expected heterozygosity were analyzed. Bayesian analysis, AMOVA and
PCOa were used to reveal the molecular genetic structure of the populations, using the programs Structure
and GenAIEx 6.5, respectively. All populations studied present great levels of gene diversity, although, there
was a greater similarity among the AUR, API and MAC populations, while RBC population presented higher
heterozygosity and less inbreeding than the others, becoming a possible refuge area in the Amazon, and the
most important population for T. speciosum conservation.

Key words: Amazon, cacauhy, genetic variability.




Resumo

O estudo da diversidade genética de Theobroma speciosum é importante, pois pode ser utilizado em programas
de melhoramento, uma vez que a espécie está intimamente relacionada a espécies de grande valor econômico,
como Theobroma cacao (cacau) e Theobroma grandiflorum (cupuaçu). Assim, o objetivo deste trabalho é
caracterizar a diversidade genética intra e interpopulacional de Theobroma speciosum em populações naturais
na Amazônia brasileira. Foram selecionados e genotipados 90 indivíduos de T. speciosum provenientes de
quatro populações situadas em diferentes estados da Amazônia Legal. Os dados foram obtidos por meio da
análise de microssatélite e a diversidade genética foi caracterizada através do número de alelos, número de
alelos privados, índice de fixação e heterozigosidade observada e esperada. A análise bayesiana, a AMOVA
e PCOa foram utilizadas para revelar a estrutura genética molecular das populações, através dos programas
Structure e GenAIEx 6.5, respectivamente. Todas as populações estudadas apresentaram níveis de diversidade
gênica, contudo, as populações AUR, API e MAC apresentaram grande similaridade, enquanto a população
de Rio Branco apresentou maior heterozigosidade e menor endogamia do que as outras, se tornando um ponto
de refúgio na Amazônia, e a mais importante população para a conservação de T. speciosum.

Palavras-chave: Amazônia, cacauí, variabilidade genética.

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