04542nab a2200349 i 4500 BR-BrBNA 20240809181918.0 240809b2017 bl.qr|pooa||| 00| 0 eng | BR-BrBNA eng U10 F30 F50 Carvalho, F.J. Maciel, G.M. De Oliveira, C.S. Nogueira, A.P.O. Glasenapp, J.A. Siquieroli, A.C.S. Comparison of clustering methods to study genetic divergence in pepper accesses at vegetative stage Publicação on-line; 42 ref.; 3 tables; 2 illus.; Summaries (En, Pt) ABSTRACT: his study aimed evaluating the genetic divergence of vegetative stage in pepper access by means of multivariate analysis and testing the efficiency of different methods. In order to reach this goal 65 accessions from the Germplasm Bank of Capsicum spp of the Federal University of Uberlândia-Brazil were evaluated concerning the following qualitative characteristics: presence of nodal anthocyanin, shape of the stem, presence of trichomes on the plant, branching habit, coloring of the leaves, leaf shape, pubescence of the leaves and leaf margin. The quantitative characteristics such as length and width of leaves were also evaluated. Qualitative characters were grouped as multi-categorical variables and the dissimilarity matrix was calculated based on the Cole-Rogers distance. As for quantitative traits, the dissimilarity matrix was measured by Euclidean distance average. Matrices were added in order to apply the clustering methods approach. Three clustering techniques were applied: Tocher optimization method, UPGMA and principal component analysis. Average and mode of the groups generated were also calculated. Validation of Tocher and UPGMA clusters was determined by cophenetic correlation coefficient. There was divergence among the accessions evaluated. UPGMA methods, Tocher and principal components were efficient and converged in the identification of distinct groups regarding the vegetative phase of pepper access. Keywords: Capsicum; morphological characterization; diversity; germplasm. RESUMO: Comparação de métodos de agrupamento no estuda da diversidade genética em acessos de pimenta na fase vegetativa. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a divergência genética na fase vegetativa em acessos de pimenta por meio de análise multivariada e testar a eficiência de diferentes métodos. Foram avaliados 65 acessos pertencentes ao Banco de Germoplasma de Capsicum spp da Universidade Federal de Uberlândia-Brasil. Avaliou-se as seguintes características qualitativas: presença de antocianina nodal, formato da haste, presença de tricomas na planta, hábito de ramificação, coloração das folhas, forma da folha, pubescência nas folhas, margem da folha, além de características quantitativas como comprimento e largura das folhas. Os caracteres qualitativos foram agrupados como variáveis multicategóricas e a matriz de dissimilaridade foi calculada pela distância de Cole-Rodgers. Para os caracteres quantitativos, a matriz de dissimilaridade foi mensurada pela distância euclidiana média. As matrizes foram somadas para a aplicação dos métodos de agrupamento. Foram realizadas três técnicas de agrupamento aos acessos: método de otimização de Tocher, UPGMA e análise de componentes principais. A média e moda dos grupos formados foram também calculadas. O coeficiente de correlação cofenético foi determinado para validação dos agrupamentos de Tocher e UPGMA. Houve divergência genética entre os acessos avaliados. Os métodos de agrupamento UPGMA, Tocher e componentes principais foram eficientes e convergentes na identificação de grupos distintos na fase vegetativa de acessos de pimenta. Palavras-chave: Capsicum; caracterização morfológica; diversidade; germoplasma. CAPSICUM SP MORFOLOGIA VEGETAL BIODIVERSIDADE VARIAÇÃO GENÉTICA GERMOPLASMA 3543 317119 Botucatu-SP Instituto de Biociências - Departamento de Química e Bioquímica 1998 2024-3719 Revista Brasileira de Plantas Medicinais (Brazil) 1516-0572 v. 19(2) p. 236-243; (2017) BR2024002107 https://www.sbpmed.org.br/admin/files/papers/file_3Dw4bXnIl9Tf.pdf Analítica 300822 300822