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003			BR-BrBNA
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008			250904b2021 bl.ar|pooa||| 00| 0 eng |
040			_aBR-BrBNA _beng
072			_aF30
072			_aF70
100			_aGrabiele, Mauro
100			_aAguilera, Patricia Mabel
100			_aDucasse, Daniel Adrián
100			_aDebat, Humberto Julio
245			_aMolecular characterization of the 5S rDNA non-transcribed spacer and reconstruction of phylogenetic relationships in Capsicum
500			_aPublicação on-line; Bibliography p. 18-21 (66 ref.); 2 tables; 10 illus.; Summaries (En, Es)
520			_a Abstract Capsicum includes ca. 41 species of chili peppers. In this original report we PCR amplified, cloned, sequenced and characterized the 5S rDNA non-transcribed spacer -NTS- in 23 taxa of nine clades of Capsicum, divergent at geographical origin and fruit and chromosome traits, and compared the NTS features throughout Solanaceae. According to GC content, inner variability and regulatory elements, the NTS organizes into three distinct structural regions; genetic variability at the NTS in Capsicum and related genus clusters into defined taxa hierarchies. Based on the reconstruction of a maximum-likelihood phylogenetic tree and phylogenetic networks, NTS sequences of Capsicum and related taxa grouped into well recognized categories -genus, section, clade, species, variety-. An evolutionary scenario arose from combined genetic and phylogenetic NTS data, in which monophyly and lineage diversification over time of Capsicum are addressed. Our analysis is original to include all domesticated species of Capsicum prevailing in germplasm collections and breeding programs, together with a large group of wild taxa that demanded further genetic characterization. The NTS set up as a double purpose marker in Capsicum, to directly evaluate genetic variability and reconstruct phylogenetic relationships to a broad extent, and constitutes a valuable tool for germplasm characterization and evolutionary studies within Solanaceae. Key words: chili peppers, genetic variability, molecular double purpose marker, phylogeny, ribosomal NTS. Resumen Capsicum incluye ca. 41 especies de ajíes. En este trabajo original, el espaciador no-transcrito (NTS) del ADNr 5S fue PCR-amplificado, clonado, secuenciado y caracterizado en 23 taxones de nueve clados de Capsicum, divergentes en origen, fruto y cromosomas, y comparado a lo largo de Solanaceae. El NTS se organiza en tres regiones estructurales distintas de acuerdo a contenido GC, variabilidad y elementos reguladores; la variabilidad genética del NTS en Capsicum y géneros relacionados se agrupó en categorías taxonómicas definidas. Las secuencias NTS de Capsicum y taxa relacionados también se agruparon en categorías reconocidas -género, sección, clado, especie, variedad- durante la reconstrucción de un árbol filogenético de máxima-verosimilitud y diversas redes filogenéticas. De la combinación de datos genéticos y filogenéticos del NTS surge un escenario evolutivo que considera monofilia y diversificación de Capsicum a lo largo del tiempo. Nuestro análisis es original al incluir todas las especies domesticadas de Capsicum, mayoritarias en colecciones y programas, además de un amplio número de ajíes silvestres que demandaban mayor caracterización genética. El NTS constituye un marcador de doble propósito en Capsicum, al evaluar directamente variabilidad genética y reconstruir relaciones filogenéticas extensas, además de ser útil a la caracterización de germoplasma y estudios evolutivos en Solanaceae. Palabras clave: ajíes, variabilidad genética, marcador molecular de doble propósito, filogenia, NTS ribosómico
650			_aPIMENTA
650			_aCAPSICUM SP
650			_aVARIAÇÃO GENÉTICA
650			_aMARCADOR MOLECULAR
650			_aFILOGENIA
773	0		_0709 _9357347 _dRio de Janeiro-RJ Jardim Botanico do Rio de Janeiro 1935 _o2025-5311 _tRodriguésia (Brazil) _x0370-6583; 2175-7860 on-line _gv. 72 p. 1-21; (2021) _wBR2025002188
856			_uhttps://www.scielo.br/j/rod/a/mKbrh6B3GsMRvJj3cf9fVFL/?format=pdf&lang=en
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999			_c337980 _d337980