000 04386nab a2200313 i 4500
003 BR-BrBNA
005 20251001175209.0
008 251001b2022 bl.ar|pooa||| 00| 0 eng |
040 _aBR-BrBNA
_beng
072 _aF30
100 _aMelo, Priscila Zei
100 _aAntunes, Adriana Maria
100 _aFernandes, Jordana Gontijo
100 _aTargueta, Cíntia Pelegrineti
100 _aGuimarães, Rejane Araújo
100 _aBoaventura-Novaes, Carolina Ribeiro Diniz
100 _aSoares, Thannya Nascimento
245 _aDevelopment of microsatellite markers in Pterodon pubescens and transferability to Pterodon emarginatus, two Brazilian plant species with medicinal potential
500 _aPublicação on-line; 41 ref.; 1 table; Summaries (En, Pt)
520 _a Abstract Pterodon pubescens and P. emarginatus (Leguminosae) are native medicinal plants of Brazil. Extractivism due to its therapeutic properties threatens populations of both species. Studies of genetic diversity is a way to reason the use and promote conservation. We developed microsatellite markers for P. pubescens and transferred them to P. emarginatus to further genetic diversity investigation of these species. From genomic sequences of P. pubescens, obtained via the Illumina MiSeq platform, it was possible to identify 6,514 microsatellite regions, to design 5,419 primer pairs, and to test 30 markers amplification. We provide 26 polymorphic microsatellite markers, 10 of which were genotyped in 48 individuals per species. The number of alleles per locus range from 3 to 16, with high average genetic diversity (P. pubescens HE = 0.753; P. emarginatus HE = 0.691). The genotyped markers have a high paternity exclusion probability (Q values greater than 0.99) and low probability of identity, indicating that set of loci is capable of individual discriminating in P. pubescens and P. emarginatus. Microsatellite markers provided in this study are a tool for population genetics studies and conservation of the two species and can be applied to closely related non-model species. Key words: genetic diversity, Illumina MiSeq, molecular markers, neotropical tree, “sucupira-branca”. Resumo Pterodon pubescens e P. emarginatus (Leguminosae) são duas espécies de plantas nativas medicinais do Brasil. As populações têm sido ameaçadas pelo extrativismo para uso de suas propriedades terapêuticas. Estudos de diversidade genética ajudam a racionalizar o uso e a promover a conservação dessas espécies. Nós desenvolvemos marcadores microssatélites para P. pubescens e transferimos para P. emarginatus com intuito de permitir investigações futuras da diversidade genética das espécies. A partir de sequências genômicas de P. pubescens, obtidas via plataforma Illumina MiSeq, foi possível identificar 6.514 regiões microssatélites, desenhar 5.419 pares de primers, e testar a amplificação de 30 marcadores. Nós fornecemos 26 marcadores moleculares, 10 dos quais foram usados para genotipar 48 indivíduos de cada espécie. O número de alelos por locus variou de 3 a 16, com alta diversidade genética média para ambas as espécies (P. pubescens HE = 0,753; P. emarginatus HE = 0,691). Os dez marcadores apresentaram boa probabilidade de exclusão de falsa paternidade (com valores acima de 0,99) e baixos valores de probabilidade de identidade, indicando que esse conjunto é adequado para discriminar indivíduos em P. pubescens e P. emarginatus. Os marcadores microssatélites desenvolvidos neste trabalho representam uma ferramenta promissora para estudos de genética de populações e conservação das duas espécies e podem, eventualmente, ser aplicados a espécies não-modelos filogeneticamente próximas. Palavras-chave: diversidade genética, Illumina MiSeq, marcadores moleculares, árvores neotropicais, “sucupira-branca”.
650 _aVARIAÇÃO GENÉTICA
650 _aMARCADOR MOLECULAR
650 _aSUCUPIRA
650 _aPTERODON PUBESCENS
773 0 _0709
_9357916
_dRio de Janeiro-RJ Jardim Botanico do Rio de Janeiro 1935
_o2025-5881
_tRodriguésia (Brazil)
_x0370-6583; 2175-7860 on-line
_gv. 73 p. 1-8; (2022)
_wBR2025002638
856 _uhttps://www.scielo.br/j/rod/a/wz5wQPfB6K6FMFSs3tXn45R/?format=pdf&lang=en
942 _cANA
999 _c338524
_d338524