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An efficient method for total RNA extraction from leaves of arboreal species from the Brazilian Cerrado (Registro n. 337458)

MARC details
000 -LÍDER
fixed length control field 03297nab a2200301 i 4500
003 - CÓDIGO MARC DA AGÊNCIA CATALOGADORA
Campo de controle BR-BrBNA
005 - DATA E HORA DA ÚLTIMA ATUALIZAÇÃO
Campo de controle 20250805164156.0
008 - CAMPO DE TAMANHO FIXO
fixed length control field 250805b2020 bl.ar|pooa||| 00| 0 eng |
040 ## - FONTE DA CATALOGAÇÃO
Agência catalogadora BR-BrBNA
Idioma da catalogação eng
072 ## - CATEGORIA AGRIS
Código AGRIS F30
072 ## - CATEGORIA AGRIS
Código AGRIS F40
072 ## - CATEGORIA AGRIS
Código AGRIS F70
100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL
Nome pessoal Rocha, Geisiane Alves
100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL
Nome pessoal Dias, Vanessa Duarte
100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL
Nome pessoal Carrer-Filho, Renato
100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL
Nome pessoal Cunha, Marcos Gomes da
100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL
Nome pessoal Dianese, Érico de Campos
245 ## - TÍTULO PRINCIPAL
Título principal An efficient method for total RNA extraction from leaves of arboreal species from the Brazilian Cerrado
500 ## - NOTA GERAL
Nota geral Publicação on-line; 25 ref.; 2 tables; 3 illus.; Summaries (En, Pt)
942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA)
Koha item type Analítica
520 ## - NOTA DE RESUMO
Nota de conteúdo <br/><br/>Abstract<br/><br/>Considering the lack of information on RNA extraction from arboreal species, specially from the Brazilian<br/>Cerrado, the aim of this study was to test RNA extraction methods for a wide variety of native plant species<br/>from this biome. The methods tested consisted of: (i) TRIzol® reagent, (ii) TRIzol® reagent with modifications,<br/>(iii) CTAB buffer, and (iv) Modified CTAB buffer, initially for leaf samples of Xylopia aromatica and Piper<br/>arboreum. Later the procedure with the best results was used to obtain purified RNA from 17 other native<br/>species. Based on A260/A280 absorbance ratio the Modified CTAB method was the best for total RNA<br/>extraction for those woody species. Ten out of eleven species tested through RT-PCR generated fragments of<br/>the expected size from the total RNA extracted by the selected method, confirming it as the best option to obtain<br/>high-quality RNA for molecular analyses and for use in the detection of viruses infecting these tree species.<br/><br/>Key words: Cerrado Biome, cDNA, RT-PCR, woody species.<br/><br/><br/><br/><br/>Resumo<br/><br/>Considerando a falta de informação para extração de RNA de plantas arbóreas, especialmente as do Cerrado<br/>brasileiro, o objetivo do estudo foi testar métodos de extração de RNA para uma ampla variedade de espécies<br/>de plantas nativas deste bioma. Os métodos testados foram: (i) reagente TRIzol®, (ii) reagente TRIzol® com<br/>modificações, (iii) tampão CTAB e (iv) tampão CTAB modificado, inicialmente para amostras foliares de<br/>Xylopia aromatica e Piper arboreum. O procedimento com melhores resultados foi utilizado posteriormente<br/>para obtenção de RNA de 17 outras espécies nativas. Baseado na razão de absorbância A260/A280 o método<br/>com CTAB modificado mostrou-se melhor para extração de RNA destas espécies arbóreas. Dez das onze<br/>espécies testadas por meio de RT-PCR geraram fragmentos de tamanho esperado a partir do RNA total<br/>extraído utilizando o método selecionado, confirmando-o como melhor opção para obtenção de RNA de<br/>alta qualidade para análises moleculares e para uso na detecção de vírus infectando essas espécies arbóreas.<br/><br/>Palavras-chave: Bioma Cerrado, cDNA, RT-PCR, espécies lenhosas.
650 ## - ASSUNTO - THESAGRO
Cabeçalho tópico ou nome geográfico CERRADO
650 ## - ASSUNTO - THESAGRO
Cabeçalho tópico ou nome geográfico PLANTA LENHOSA
650 ## - ASSUNTO - THESAGRO
Cabeçalho tópico ou nome geográfico RNA
773 0# - ENTRADA ANALÍTICA
Host Biblionumber 709
Registro do item 353216
Imprenta Rio de Janeiro-RJ Jardim Botanico do Rio de Janeiro 1935
Outro identificador 2025-4473
Título Rodriguésia (Brazil)
ISSN 0370-6583; 2175-7860 on-line
Colação v. 71 p. 1-10; (2020)
Número de controle de registro BR2025003221
856 ## - ACESSO E ENDEREÇO ELETRÔNICO
Identificador uniforme de recurso - URI https://www.scielo.br/j/rod/a/QSV7qSpMCgYJKWkTv8xfNWs/?format=pdf&lang=en

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