Publicação on-line; 25 ref.; 2 tables; 3 illus.; Summaries (En, Pt)

Abstract

Considering the lack of information on RNA extraction from arboreal species, specially from the Brazilian
Cerrado, the aim of this study was to test RNA extraction methods for a wide variety of native plant species
from this biome. The methods tested consisted of: (i) TRIzol® reagent, (ii) TRIzol® reagent with modifications,
(iii) CTAB buffer, and (iv) Modified CTAB buffer, initially for leaf samples of Xylopia aromatica and Piper
arboreum. Later the procedure with the best results was used to obtain purified RNA from 17 other native
species. Based on A260/A280 absorbance ratio the Modified CTAB method was the best for total RNA
extraction for those woody species. Ten out of eleven species tested through RT-PCR generated fragments of
the expected size from the total RNA extracted by the selected method, confirming it as the best option to obtain
high-quality RNA for molecular analyses and for use in the detection of viruses infecting these tree species.

Key words: Cerrado Biome, cDNA, RT-PCR, woody species.




Resumo

Considerando a falta de informação para extração de RNA de plantas arbóreas, especialmente as do Cerrado
brasileiro, o objetivo do estudo foi testar métodos de extração de RNA para uma ampla variedade de espécies
de plantas nativas deste bioma. Os métodos testados foram: (i) reagente TRIzol®, (ii) reagente TRIzol® com
modificações, (iii) tampão CTAB e (iv) tampão CTAB modificado, inicialmente para amostras foliares de
Xylopia aromatica e Piper arboreum. O procedimento com melhores resultados foi utilizado posteriormente
para obtenção de RNA de 17 outras espécies nativas. Baseado na razão de absorbância A260/A280 o método
com CTAB modificado mostrou-se melhor para extração de RNA destas espécies arbóreas. Dez das onze
espécies testadas por meio de RT-PCR geraram fragmentos de tamanho esperado a partir do RNA total
extraído utilizando o método selecionado, confirmando-o como melhor opção para obtenção de RNA de
alta qualidade para análises moleculares e para uso na detecção de vírus infectando essas espécies arbóreas.

Palavras-chave: Bioma Cerrado, cDNA, RT-PCR, espécies lenhosas.