The DNAJ gene family in yerba mate (Ilex paraguariensis): genome-wide identification, structural characterization, orthology based classification and expression analysis (Registro n. 339137)
[ somente texto ]
| 000 -LÍDER | |
|---|---|
| fixed length control field | 04542nab a2200313 i 4500 |
| 003 - CÓDIGO MARC DA AGÊNCIA CATALOGADORA | |
| Campo de controle | BR-BrBNA |
| 005 - DATA E HORA DA ÚLTIMA ATUALIZAÇÃO | |
| Campo de controle | 20251121101638.0 |
| 008 - CAMPO DE TAMANHO FIXO | |
| fixed length control field | 251121b2023 bl.ar|pooa||| 00| 0 eng | |
| 040 ## - FONTE DA CATALOGAÇÃO | |
| Agência catalogadora | BR-BrBNA |
| Idioma da catalogação | eng |
| 072 ## - CATEGORIA AGRIS | |
| Código AGRIS | F30 |
| Código do objeto | 2140 |
| 072 ## - CATEGORIA AGRIS | |
| Código AGRIS | F01 |
| 072 ## - CATEGORIA AGRIS | |
| Código AGRIS | F60 |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Aguilera, Patricia Mabel |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Debat, Humberto Julio |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Castrillo, María Lorena |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Bich, Gustavo Angel |
| 100 ## - ENTRADA PRINCIPAL - NOME PESSOAL | |
| Nome pessoal | Grabiele, Mauro |
| 245 ## - TÍTULO PRINCIPAL | |
| Título principal | The DNAJ gene family in yerba mate (Ilex paraguariensis): genome-wide identification, structural characterization, orthology based classification and expression analysis |
| 500 ## - NOTA GERAL | |
| Nota geral | Publicação on-line; Bibliography p. 22-25 (72 ref.); 1 table; 4 illus.; Summaries (En, Es) |
| 942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA) | |
| Koha item type | Analítica |
| 520 ## - NOTA DE RESUMO | |
| Nota de conteúdo | <br/><br/>Abstract<br/><br/>Dry leaves and twigs of yerba mate are widely infusion-consumed in southern Southamerica. Endemic and adapted<br/>to the Atlantic Forest, its extensive full-sun monoculture links to diverse biotic (pest, pathogens) and abiotic<br/>stresses (solar radiation, drought), impacting its productivity, ecology and socioeconomic niche. We focused in<br/>comprehensively characterize the DNAJ gene family in yerba mate to predict its possible roles on development and<br/>diverse stress responses to further assist crop manage. Our results suggest that yerba mate DNAJ proteins account<br/>140 diverse members of six structural types displaying potential variable roles in protein homeostasis control.<br/>We were able to classify them into 51 distinct orthology groups, in agreement to Arabidopsis, and performed<br/>translational genomics of function, localization, expression and stress responsiveness data. Genome mapping and<br/>expression analysis indicated that yerba mate DNAJ genes differ in expression, nucleotide composition, length<br/>and exon-intron structure. Intronless or few introns genes -linked to rapid stress response- accounted 85 DNAJs.<br/>Promoters of DNAJ genes harbored a 73.2% of cis-acting regulatory elements involved in response to diverse<br/>stresses, hormones and light, simultaneously. We hypothesize that yerba mate DNAJs assist to plant survival<br/>during multiple stresses linked to current dominant agroecosystem but promote its growth under shade.<br/><br/>Key words: chaperones, crop tree, stress genes, translational genomics.<br/><br/><br/><br/><br/><br/>Resumen<br/><br/>Las hojas y ramitas secas de yerba mate son ampliamente consumidas como infusión en el sur de Sudamérica.<br/>Endémica y adaptada a la Mata Atlántica, el monocultivo extensivo de esta planta a pleno sol se vincula a diversos<br/>estreses bióticos (pestes, patógenos) y abióticos (radiación solar, sequía) que impactan en su productividad, ecología<br/>y nicho socioeconómico. El objetivo de este trabajo fue caracterizar exhaustivamente la familia de genes DNAJ<br/>en yerba mate a fin de predecir sus posibles roles en el desarrollo y en las respuestas a diversos estreses para así<br/>contribuir al manejo del cultivo. Nuestros resultados sugieren que las proteínas DNAJ de yerba mate contabilizan<br/>140 miembros diversos de seis tipos estructurales, con diferentes roles potenciales en el control de la homeostasis<br/>proteica. Asimismo, fueron clasificadas en 51 grupos ortólogos distintos, de acuerdo con Arabidopsis, y se realizó<br/>la genómica traslativa de datos de función, localización, expresión y respuesta a estrés. El mapeo genómico y los<br/>análisis de expresión indicaron que los genes DNAJ de yerba mate difieren en expresión, composición nucleotídica,<br/>longitud y estructura exón-intrón. Se encontró que 85 genes DNAJ no presentan o poseen pocos intrones -ligados<br/>a una rápida respuesta a estrés-. Los promotores de genes DNAJ albergan un 73,2 % de elementos reguladores<br/>en cis involucrados en respuesta a diversos estreses, hormonas y luz, simultáneamente. Así, proponemos que<br/>las DNAJs de yerba mate asisten a la planta en su supervivencia durante múltiples estreses ligados al actual<br/>agroecosistema dominante, mientras que bajo sombra promueven su crecimiento.<br/><br/>Palabras clave: chaperonas, árbol cultivado, genes de estrés, genómica traslativa. |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | GENE |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | GENÉTICA |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | MATE |
| 650 ## - ASSUNTO - THESAGRO | |
| Cabeçalho tópico ou nome geográfico | ILEX PARAGUARIENSIS |
| 773 0# - ENTRADA ANALÍTICA | |
| Host Biblionumber | 709 |
| Registro do item | 359038 |
| Imprenta | Rio de Janeiro-RJ Jardim Botanico do Rio de Janeiro 1935 |
| Outro identificador | 2025-7012 |
| Título | Rodriguésia (Brazil) |
| ISSN | 0370-6583; 2175-7860 on-line |
| Colação | v. 74 p. 1-25; (2023) |
| Número de controle de registro | BR2025004458 |
| 856 ## - ACESSO E ENDEREÇO ELETRÔNICO | |
| Identificador uniforme de recurso - URI | https://www.scielo.br/j/rod/a/8bqJkPHtMZv9bShDP7C9Z7g/?format=pdf&lang=en |
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