Publicação on-line; Bibliography p. 22-25 (72 ref.); 1 table; 4 illus.; Summaries (En, Es)

Abstract

Dry leaves and twigs of yerba mate are widely infusion-consumed in southern Southamerica. Endemic and adapted
to the Atlantic Forest, its extensive full-sun monoculture links to diverse biotic (pest, pathogens) and abiotic
stresses (solar radiation, drought), impacting its productivity, ecology and socioeconomic niche. We focused in
comprehensively characterize the DNAJ gene family in yerba mate to predict its possible roles on development and
diverse stress responses to further assist crop manage. Our results suggest that yerba mate DNAJ proteins account
140 diverse members of six structural types displaying potential variable roles in protein homeostasis control.
We were able to classify them into 51 distinct orthology groups, in agreement to Arabidopsis, and performed
translational genomics of function, localization, expression and stress responsiveness data. Genome mapping and
expression analysis indicated that yerba mate DNAJ genes differ in expression, nucleotide composition, length
and exon-intron structure. Intronless or few introns genes -linked to rapid stress response- accounted 85 DNAJs.
Promoters of DNAJ genes harbored a 73.2% of cis-acting regulatory elements involved in response to diverse
stresses, hormones and light, simultaneously. We hypothesize that yerba mate DNAJs assist to plant survival
during multiple stresses linked to current dominant agroecosystem but promote its growth under shade.

Key words: chaperones, crop tree, stress genes, translational genomics.





Resumen

Las hojas y ramitas secas de yerba mate son ampliamente consumidas como infusión en el sur de Sudamérica.
Endémica y adaptada a la Mata Atlántica, el monocultivo extensivo de esta planta a pleno sol se vincula a diversos
estreses bióticos (pestes, patógenos) y abióticos (radiación solar, sequía) que impactan en su productividad, ecología
y nicho socioeconómico. El objetivo de este trabajo fue caracterizar exhaustivamente la familia de genes DNAJ
en yerba mate a fin de predecir sus posibles roles en el desarrollo y en las respuestas a diversos estreses para así
contribuir al manejo del cultivo. Nuestros resultados sugieren que las proteínas DNAJ de yerba mate contabilizan
140 miembros diversos de seis tipos estructurales, con diferentes roles potenciales en el control de la homeostasis
proteica. Asimismo, fueron clasificadas en 51 grupos ortólogos distintos, de acuerdo con Arabidopsis, y se realizó
la genómica traslativa de datos de función, localización, expresión y respuesta a estrés. El mapeo genómico y los
análisis de expresión indicaron que los genes DNAJ de yerba mate difieren en expresión, composición nucleotídica,
longitud y estructura exón-intrón. Se encontró que 85 genes DNAJ no presentan o poseen pocos intrones -ligados
a una rápida respuesta a estrés-. Los promotores de genes DNAJ albergan un 73,2 % de elementos reguladores
en cis involucrados en respuesta a diversos estreses, hormonas y luz, simultáneamente. Así, proponemos que
las DNAJs de yerba mate asisten a la planta en su supervivencia durante múltiples estreses ligados al actual
agroecosistema dominante, mientras que bajo sombra promueven su crecimiento.

Palabras clave: chaperonas, árbol cultivado, genes de estrés, genómica traslativa.